Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxc4Q08624 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms