Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou6f1Q07916 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou6f1Q07916 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms