Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MestQ07646 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MestQ07646 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MestQ07646 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MestQ07646 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms