Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a2Q07643 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms