Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col17a1Q07563 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col17a1Q07563 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms