Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf9Q07105 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf9Q07105 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf9Q07105 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms