Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf3Q07104 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms