Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah1bQ06985 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah1bQ06985 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms