Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CluQ06890 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CluQ06890 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CluQ06890 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CluQ06890 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CluQ06890 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CluQ06890 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CluQ06890 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms