Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39Q06138 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms