Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprgQ05909 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprgQ05909 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms