Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rcn1Q05186 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms