Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top1Q04750 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms