Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms