Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms