Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd1Q04519 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms