Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms