Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelaQ04207 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms