Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnd1Q03719 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms