Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scg2Q03517 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms