Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff2Q03404 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms