Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl7Q03366 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl7Q03366 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccl7Q03366 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms