Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddr1Q03146 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddr1Q03146 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms