Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha4Q03137 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha4Q03137 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms