Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkczQ02956 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms