Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col6a2Q02788 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col6a2Q02788 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms