Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RykQ01887 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RykQ01887 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RykQ01887 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RykQ01887 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RykQ01887 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RykQ01887 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RykQ01887 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RykQ01887 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RykQ01887 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms