Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbp1Q01514 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms