Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Top2aQ01320 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2aQ01320 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top2aQ01320 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms