Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms