Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col1a2Q01149 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col1a2Q01149 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms