Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Grin2bQ01097 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Grin2bQ01097 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2bQ01097 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2bQ01097 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2bQ01097 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Grin2bQ01097 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms