Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde1bQ01065 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms