Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfaQ00731 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms