Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SeleQ00690 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SeleQ00690 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms