Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AlkP97793 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AlkP97793 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AlkP97793 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AlkP97793 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AlkP97793 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlkP97793 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlkP97793 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlkP97793 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AlkP97793 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AlkP97793 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AlkP97793 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AlkP97793 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AlkP97793 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AlkP97793 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms