Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cry1P97784 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms