Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata5P97489 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata5P97489 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gata5P97489 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms