Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pitx2P97474 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx2P97474 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms