Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bop1P97452 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms