Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps45P97390 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps45P97390 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps45P97390 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms