Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkp1P97350 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkp1P97350 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms