Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mesp1P97309 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mesp1P97309 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms