Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H3f3aP84244 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H3f3aP84244 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms