Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubg1P83887 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubg1P83887 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms