Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcaP82350 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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