Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx3P81067 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx3P81067 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms