Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cct5P80316 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms