Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp3P70677 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp3P70677 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms