Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ncoa1P70365 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncoa1P70365 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms